蘇州工業園區檔案館的館藏檔案主要包括園區管委會各局辦的檔案；園區各國控公司、各直屬單位、各街道、社工委的永久和長期保存的檔案；上述單位或其所屬的撤銷機構的全部檔案；園區各建設單位工程項目產生的市政建設、基本建設竣工檔案；具有地方特色和研究價值的歷史檔案。

園區檔案館按照 “大文化、大檔案” 理念，對全區范圍內各進館單位的檔案開展接收工作，形成了多檔合一的集中統一管理模式和門類齊全、內容豐富、結構較為合理的館藏體系，實現了真正意義上的綜合檔案館。目前檔案館館藏量為36萬卷、48萬件。

館藏檔案門類主要包括：（1）文書檔案：1993年至2013年間園區工委、管委會和管委會各局辦的文書檔案；園區管委會直屬國有企業移交的文書檔案；園區婁葑街道、斜塘街道、唯亭街道、勝浦街道移交的文書檔案。（2）城建檔案：蘇州工業園區開發建設以來在城市活動中直接形成的具有保存價值的文字材料、圖紙、聲像、電子文件等不同載體的檔案。（3）專業檔案：會計檔案、拆遷檔案、婚姻檔案、環保檔案、普查檔案、建設工程管理檔案、新聞報道檔案等。（4）歷史檔案：李超瓊日記手跡、信件、詩集；園區農民攝影家馬覲伯珍藏多年的勝浦老照片、錄像；園區唯亭離休干部潘志彤的手繪《唯亭古鎮三里長街記實圖》；舊時斜塘金家坤先生手繪的《斜塘老鎮地域圖》；非物質文化遺產珍品勝浦三寶以及緙絲、銅器等民間傳統工藝作品等。載體有紙質、照片、音像、電子、實物等。檔案館還收藏了部分法律法規、規范性文件、年鑒、地方史志和政治、經濟、文化、歷史等圖書資料以及各類檔案編研成果等。